Qu'est-ce que le microbiome intestinal? | Activia Canada

Microbiome intestinal: qu'est ce que c'est?

Votre intestin abrite une vaste communauté de micro-organismes que l'on appelle collectivement le microbiome intestinal. Dans cet article, nous explorons ce qu'est le microbiome intestinal, comment il est défini scientifiquement et comment cet écosystème microbien interagit avec votre système digestif.

Définition du microbiome: qu'est-ce que le microbiome intestinal?

Que signifie « microbiome »?

Avant tout, vous souhaitez mieux comprendre votre santé digestive, mais que signifie au juste le mot « microbiome »?

Le microbiome intestinal désigne l'ensemble des micro-organismes qui vivent dans le tube digestif¹, ainsi que leur matériel génétique et l'environnement dans lequel ils interagissent. Ces micro-organismes incluent des bactéries, des virus, des champignons et d'autres microbes — dont de nombreuses bactéries qui vivent dans différentes parties du tube digestif.²

L'intestin humain abrite une vaste communauté de micro-organismes, estimée à environ 100 billions de microbes, formant l'un des écosystèmes les plus densément peuplés de l'organisme et illustrant le rôle du microbiome dans la digestion et d'autres processus de l'organisme.

Pour résumer, une définition simple du terme « microbiome » serait l'ensemble des micro-organismes et de leur matériel génétique qui vivent et interagissent dans un environnement précis, comme le système digestif humain.

Microbiome et microbiote: quelles différences?

Les termes « microbiome » et « microbiote » sont étroitement liés, mais ont des significations légèrement différentes, ce qui aide à distinguer les deux notions.

• Microbiote désigne les micro-organismes eux-mêmes³: les bactéries, virus, champignons et autres microbes qui vivent dans un environnement particulier, comme l'intestin. Ces organismes sont les membres d'un microbiote et forment un groupe précis, comme le microbiote intestinal humain.

• Microbiome désigne les micro-organismes ainsi que leur matériel génétique — notamment leur contenu en gènes — et l'écosystème dans lequel ils interagissent, comme le microbiome intestinal humain.

Une autre caractéristique importante du microbiote intestinal humain est qu'il varie d'un individu à l'autre, ce qui signifie que chaque personne possède une communauté microbienne unique.

Quels micro-organismes vivent dans l'intestin?

Le microbiome intestinal regroupe les micro-organismes et le génome des micro-organismes qui vivent dans le tube digestif. Cet écosystème forme une communauté bactérienne intestinale unique chez chaque individu. Bien que la composition exacte varie d'une personne à l'autre, l'analyse de la composition du microbiote montre que plusieurs personnes partagent des fonctions microbiennes similaires au sein du système digestif.

Votre microbiote intestinal contribue à votre bien-être au quotidien en participant à la digestion des aliments et à l'absorption des nutriments.

Comment le microbiome intestinal interagit avec l'organisme

Microbiome et digestion

L'une des principales façons dont le microbiome intestinal interagit avec l'organisme est la digestion. Certains microbes intestinaux contribuent à décomposer des composants alimentaires que le corps humain ne peut pas digérer par lui-même, en particulier les fibres alimentaires.⁵

Au cours de ce processus, les micro-organismes fermentent ces composés et produisent des molécules appelées acides gras à chaîne courte (AGCC)⁶, notamment:

• Le butyrate

• L'acétate

• Le propionate

Ces produits de fermentation interagissent avec les cellules de l'intestin et font partie des nombreux processus biochimiques qui se déroulent dans le tube digestif. Ces processus sont également étudiés dans la recherche sur le microbiome, qui s'intéresse à certaines affections digestives comme la maladie inflammatoire de l'intestin.

Liens avec d'autres fonctions de l'organisme

Les chercheurs qui s'intéressent au microbiome s'entendent pour dire que les micro-organismes de l'intestin interagissent avec plusieurs systèmes physiologiques de l'organisme.⁷ Le tube digestif et son microbiote sont liés à des fonctions comme la digestion, le métabolisme et les interactions avec les systèmes immunitaire et nerveux, qui peuvent influencer notre bien-être général.

En raison de ces liens, les chercheurs continuent d'explorer comment les différences dans le microbiome peuvent interagir avec divers processus biologiques, notamment :

• Le métabolisme

• Les réponses immunitaires

• La communication entre l'intestin et le cerveau

Ces interactions demeurent un domaine de recherche actif, alors que les études continuent d'examiner comment les micro-organismes et le corps humain s'influencent mutuellement.

Comment se développe le microbiome intestinal

Le microbiome intestinal ne reste pas le même tout au long de la vie. Il se développe et évolue avec le temps, à mesure que l'hôte et son microbiote associé évoluent ensemble, et que différents membres du microbiome s'établissent dès les premiers stades de la vie.⁸ ⁹

Plusieurs facteurs peuvent influencer la façon dont le microbiome se développe au début de la vie, notamment :

• Le mode d'accouchement

• L'allaitement

• L'alimentation

• Les facteurs environnementaux (alimentation, antibiotiques)

Votre microbiote intestinal est unique et vous identifie comme individu, mais sa composition est très dynamique. Le microbiome intestinal est donc considéré comme dynamique plutôt que figé, et mieux comprendre le microbiome et le microbiote permet de saisir comment les micro-organismes interagissent avec l'organisme et réagissent aux changements de l'environnement.

Les facteurs qui influencent le microbiome intestinal

La composition du microbiome intestinal peut évoluer au fil du temps et être influencée par plusieurs facteurs. L'alimentation est considérée comme l'une des influences les plus importantes, puisque les aliments que nous consommons nourrissent à la fois le corps et les bactéries intestinales qui vivent dans le tube digestif et qui font partie du microbiome.¹⁰ Ce que vous mangez peut influencer le microbiote intestinal dans les 24 heures suivant un changement alimentaire.¹¹

Les aliments contenant des fibres, les aliments d'origine végétale et les aliments fermentés sont souvent étudiés parce qu'ils interagissent avec cet écosystème microbien. Les aliments fermentés (yogourt, kéfir, kimchi) apportent des micro-organismes vivants qui peuvent influencer positivement l'équilibre du microbiome. Il est toutefois important de noter que tous les aliments fermentés ne contiennent pas de probiotiques. Tous les yogourts sont fermentés, mais seuls certains contiennent des souches probiotiques ajoutées en plus des bactéries utilisées pour la fermentation. Un yogourt probiotique contient des souches précises et étudiées, ajoutées intentionnellement, et cette distinction a son importance lorsqu'on choisit un yogourt pour sa contribution potentielle au confort digestif.

Les aliments d'origine végétale contenant des polyphénols (petits fruits, huile d'olive, thé vert) soutiennent de façon sélective les bactéries bénéfiques.¹²

En résumé, certains types d'aliments sont particulièrement intéressants pour votre intestin : les produits contenant certains types de fibres comme les artichauts, les oignons, le brocoli ou les bananes servent de nourriture et peuvent apporter des nutriments à nos microbes — on les appelle les fibres prébiotiques. Quant aux produits fermentés comme le kimchi et aux aliments probiotiques comme les yogourts avec ajout de probiotiques, ils peuvent apporter de bonnes bactéries vivantes à notre intestin.

Mais l'effet des aliments ne sera pas exactement le même d'une personne à l'autre.

D'autres facteurs peuvent façonner le microbiome, notamment :

• Les médicaments, particulièrement les antibiotiques, ou les carences en vitamines

• L'activité physique

• Les habitudes de sommeil

• Le stress

• La génétique

• L'âge

• La maladie

• Le mode de vie

• La génétique

Parce que ces facteurs varient d'un individu à l'autre, le microbiome intestinal de chaque personne se développe d'une manière légèrement différente au fil du temps. Un microbiote intestinal humain diversifié est souvent associé à un bon état de bien-être et à la résilience du microbiote, c'est-à-dire à sa capacité à revenir à un état d'équilibre après une perturbation. Faire le suivi de votre santé digestive peut être une façon de suivre cette évolution dans le temps et de soutenir votre routine digestive. Et pour ajouter de la diversité à votre microbiote, vous pourriez :

• Inclure des fibres prébiotiques qui peuvent être utilisées par les microbes intestinaux:

  pommes de terre cuites et refroidies, légumineuses et légumes-racines, oignons, ail, bananes, racine de chicorée et artichauts.

• Ajouter des aliments probiotiques à votre alimentation:

  par exemple le lait fermenté, le yogourt, le kéfir avec ajout de probiotiques, etc.

• Consommer une variété de protéines d'origine animale et végétale:

  d'origine végétale (haricots, lentilles, noix, graines) et d'origine animale (viande, poisson, fruits de mer, œufs et produits laitiers).

• Inclure des aliments contenant des acides gras oméga-3 et oméga-6:

  noix de Grenoble, graines de lin, saumon et thon pour les oméga-3, par exemple; avocat, noix, graines et huiles végétales pour les oméga-6.

• Consommer une variété de vitamines et de minéraux:

  que l'on trouve dans plusieurs aliments d'origine animale, dans les fruits et légumes, les céréales à grains entiers, les noix et les légumineuses comme les haricots et les lentilles.

Mieux comprendre votre microbiome intestinal

Le microbiome intestinal est une communauté complexe de micro-organismes qui vit dans le tube digestif et qui interagit avec plusieurs processus de l'organisme. Bien que le microbiome de chaque personne soit unique et encore à l'étude, comprendre comment cet écosystème fonctionne aide à expliquer l'intérêt scientifique croissant pour la digestion et les communautés microbiennes.

Nous sommes tous acteurs de notre propre bien-être. Au fil des changements de vie et de l'environnement, notre microbiote intestinal reste avec nous. Une alimentation équilibrée, contenant des sources variées de fibres, constitue une bonne base pour un microbiote intestinal diversifié.

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